Protein Taf14 je uključen u remodeliranje strukture kromatina promotora pri aktivaciji transkripcije gena PHO5 u kvascu

završni rad

• Naslov (engleski): Protein Taf14 is involved in promoter chromatin remodeling process during activation of yeast PHO5 gene trancription
• Autor: Stela Kordić
• Mentor: Slobodan Barbarić (mentor)
• Ustanova koja je dodijelila akademski / stručni stupanj: Sveučilište u Zagrebu; Prehrambeno-biotehnološki fakultet; (Zavod za kemiju i biokemiju); (Laboratorij za biokemiju); Zagreb
• Datum i država obrane: 2014-07-10, Hrvatska
• Znanstveno / umjetničko područje, polje i grana: BIOTEHNIČKE ZNANOSTI; Nutricionizam

Sažetak

U eukariotskim stanicama DNA se nalazi u kompleksu sa histonima, odnosno u strukturi kromatina, te je transkripcijskim faktorima koji sudjeluju u regulaciji transkripcije gena, onemogućeno vezanje na DNA. Dakle, osim strukturne uloge u kondenzaciji DNA, struktura kromatina djeluje represivno na proces transkripcije gena. Stoga su modifikacije kromatina i remodeliranje strukture kromatina promotorskih regija preduvjet za aktivaciju transkripcije. Protein Taf14 je podjedinica takva tri kompleksa SWI/SNF, Ino80 i RSC, koji sudjeluju u procesu remodeliranja strukture kromatina promotora gena PHO5. Također, Taf14 je i podjedinica općih transkripcijskih faktora TFIID i TFIIF, histon-acetiltransferaze NuA3 i globalnog ko-aktivatora transkripcije, Mediatora. Uloga proteina Taf14 u procesu remodeliranja strukture kromatina kao i regulaciji transkripcije gena predmet je iscrpnih istraživanja, ali do sada se o njegovoj specifičnoj ulozi u ovim procesima vrlo malo zna. U ovom radu je, korištenjem mutanta taf14, ispitan efekt inaktivacije ovog proteina na proces aktivacije promotora PHO5. Utvrđeno je da u odsutstvu proteina Taf14 dolazi do usporenog remodeliranja kromatina promotora PHO5 i posljedično usporene aktivacije transkripcije gena.

Sažetak (engleski)

In eukaryotic cells, DNA exists as a complex with histone proteins, called chromatin, so that binding of transcription factors, which participate in transcriptional regulation, on DNA is disabled. Therefore, apart from its structural role in DNA condensation, chromatin structure acts repressive on gene transcription and chromatin remodeling is a prerequisite for promoter activation. Protein Taf14 is a subunit of three ATP- dependent remodeling complexes, SWI/SNF, Ino80 and RSC, involved in chromatin structure transition at the PHO5 promoter. It is also a subunit of general transcription factors TFIID and TFIIF, histon-acetyltransferase complex NuA3 and global co-activator of transcription, Mediator. The role of this protein as a subunit of many important proteins involved in chromatin remodeling and regulation of transcription is still mostly unknown. This work has examined the activation of PHO5 promoter in the absence of Taf14, using taf14 mutant cells. The results show a delayed PHO5 promoter chromatin remodeling process in absence of Taf14 and consequentially, a delayed activation of transcription.

• Ključne riječi: protein Taf14; gen PHO5; remodeliranje kromatina; regulacija transkripcije; kvasac S. cerevisiae
• Ključne riječi (engleski): protein Taf14; PHO5 gene; chromatin remodeling; transcriptional regulation; yeast S. cerevisiae
• Jezik: hrvatski
• URN:NBN: urn:nbn:hr:159:239395
• Studijski program: Naziv: Nutricionizam; Vrsta studija: sveučilišni; Stupanj studija: preddiplomski; Akademski / stručni naziv: sveučilišni/a prvostupnik/prvostupnica (baccalaureus/baccalaurea) nutricionizma (univ. bacc. nutr.)
• Vrsta resursa: Tekst
• Način izrade datoteke: Izvorno digitalna
• Prava pristupa: Pristup korisnicima matične ustanove
• Datum i vrijeme pohrane: 2017-04-27 13:09:18