In silico određivanje inhibitora ART1 enzima kod raka pluća ne-malih stanica metodom molekularnog pristajanja

diplomski rad

• Naslov (engleski): In silico determination of ART1 enzyme inhibitors in non-small cell lung cancer using molecular docking
• Autor: Antonia Krsnik
• Mentor: Janko Diminić (mentor)
• Mentor: Antonio Starčević (pomoć pri izradi, neposredni voditelj)
• Član povjerenstva: Anita Horvatić (predsjednik povjerenstva)
• Član povjerenstva: Antonio Starčević (član povjerenstva)
• Član povjerenstva: Igor Stuparević (član povjerenstva)
• Ustanova koja je dodijelila akademski / stručni stupanj: Sveučilište u Zagrebu; Prehrambeno-biotehnološki fakultet; (Zavod za biokemijsko inženjerstvo); (Kabinet za bioinformatiku); Zagreb
• Datum i država obrane: 2023-07-07, Hrvatska
• Znanstveno / umjetničko područje, polje i grana: BIOTEHNIČKE ZNANOSTI; Biotehnologija

Sažetak

Cilj ovog diplomskog rada bio je odrediti potencijalne inhibitore ART1 enzima kod raka pluća ne-malih stanica in silico metodom molekularnog pristajanja (engl. molecular docking). Katalitička domena ART1 enzima eksperimirana je na površini tumorskih stanica te posttranslacijskom modifikacijom P2X7 receptora CD8+ T imunoloških stanica koje se nalaze u blizini uzrokuje NAD induciranu smrt stanice (engl. NAD-induced cell death, NICD). Kao potencijalni inhibitori spomenutog ART1 enzima testirani su prirodni spojevi te strukturni analozi sintetskih spojeva koji su se pokazali kao inhibitori iste obitelji enzima u koje spada i ART1 enzim (PARP i MART enzimi). Molekularno pristajanje provedeno je na web poslužitelju SwissDock nakon čega je slijedila validacija rezultata u AutoDock programu. Na temelju rezultata molekularnog pristajanja, u uži izbor potencijalnih inhibitora izabrana su četiri spoja čija su svojstva zatim detaljnije razmotrena.

Sažetak (engleski)

The aim of this master's thesis was to determine potential inhibitors of ART1 enzyme in non-small cell lung cancer (NSCLC) in silico using molecular docking. The catalytic domain of the ART1 enzyme is expressed on the surface of tumor cells and post-translational modification of the P2X7 receptor of nearby CD8+ T immune cells causes NAD-induced cell death. As potential inhibitors of the aforementioned ART1 enzyme, natural compounds and structural analogues of synthetic compounds were tested, which proved to be inhibitors of the same family of enzymes that include ART1 enzyme (PARP and MART enzymes). Molecular docking was carried out on the SwissDock web server followed by validation of the results in the AutoDock program. Based on the results of molecular docking, four compounds were shortlisted in the selection of potential inhibitors whose properties were then considered in more detail.

• Ključne riječi: in silico; molekularno pristajanje; ART1 enzim; inhibitori; svojstva inhibitora
• Ključne riječi (engleski): in silico; molecular docking; ART1 enzyme; inhibitors; inhibitor properties
• Jezik: hrvatski
• URN:NBN: urn:nbn:hr:159:498807
• Studijski program: Naziv: Molekularna biotehnologija; Vrsta studija: sveučilišni; Stupanj studija: diplomski; Akademski / stručni naziv: magistar/magistra inženjer/inženjerka molekularne biotehnologije (mag. ing. biotechn.)
• Vrsta resursa: Tekst
• Način izrade datoteke: Izvorno digitalna
• Prava pristupa: Otvoreni pristup
• Datum i vrijeme pohrane: 2024-06-21 11:10:24