Inhibicija uzročnika račje kuge, Aphanomyces astaci Schikora 1906, bakterijskim izolatima s kutikule rakova

diplomski rad

• Naslov (engleski): Inhibition of crayfish plague pathogen, Aphanomyces astaci Schikora 1906, by bacterial isolates from crayfish exoskeleton
• Autor: Lucija Vukšić
• Mentor: Ana Bielen (mentor)
• Član povjerenstva: Reno Hrašćan (predsjednik povjerenstva)
• Ustanova koja je dodijelila akademski / stručni stupanj: Sveučilište u Zagrebu; Prehrambeno-biotehnološki fakultet; (Zavod za biokemijsko inženjerstvo); (Laboratorij za biologiju i genetiku mikroorganizama); Zagreb
• Datum i država obrane: 2022-06-28, Hrvatska
• Znanstveno / umjetničko područje, polje i grana: BIOTEHNIČKE ZNANOSTI; Biotehnologija

Sažetak

Račja kuga, uzrokovana patogenom Aphanomyces astaci, ugrožava prirodne populacije slatkovodnih rakova te uzrokuje ekonomske gubitke u akvakulturi rakova. Cilj ovog rada bio je istražiti inhibicijski potencijal bakterijskih izolata s kutikule rakova prema rastu micelija patogena A. astaci. Analizom gena koji kodira za 16S rRNA identificirano je 145 bakterijskih izolata s kutikule signalnog, uskoškarog, riječnog, potočnog i bjelonogog raka. Neovisno o vrsti raka, najveći udio izolata bio je iz koljena Proteobacteria (66 %, uključujući najčešće rodove Pseudomonas i Aeromonas), zatim Bacteroidetes (18 %, s najčešćim rodom Flavobacterium), Firmicutes (13 %), Actinobacteria (2 %) i Cyanobacteria (1 %). Nadalje, provedeni su in vitro testovi inhibicije prema kojima su izolati razvrstani u inhibitore (13 %, najčešće iz rodova Pseudomonas i Aeromonas) i ne-inhibitore (87 %). Zaključno, rezultati ovog rada otvaraju mogućnost primjene bakterija kao ekološki prihvatljive metode kontrole patogena A. astaci u akvakulturi.

Sažetak (engleski)

Crayfish plague, caused by the pathogen Aphanomyces astaci, threatens natural freshwater crayfish and causes economic losses in astaciculture. The aim of this study was to investigate the inhibitory potential of bacterial isolates from the crayfish exoskeleton against mycelial growth of A. astaci. A total of 145 bacterial isolates from the exoskeleton of signal crayfish, narrow-clawed crayfish, noble crayfish, stone crayfish and white-clawed crayfish were identified by 16S rRNA gene analysis. Regardless of the crayfish species, most isolates belonged to the phylum Proteobacteria (66 %, including the most common genera Pseudomonas and Aeromonas), followed by Bacteroidetes (18 %, most commonly the genus Flavobacterium), Firmicutes (13 %), Actinobacteria (2 %) and Cyanobacteria (1 %). In addition, in vitro inhibition tests were performed, according to which the isolates were classified as inhibitors (13 %, most frequently from the genera Pseudomonas and Aeromonas) or non-inhibitors (87 %). The results of this work open up the perspective of using bacteria as an environmentally acceptable method of controlling A. astaci in aquaculture.

• Ključne riječi: deseteronožni rakovi; astacikultura; biokontrola; 16S rRNA; testovi inhibicije
• Ključne riječi (engleski): decapod crayfish; biocontrol; bacterial isolates; 16S rRNA; plate inhibition assay
• Jezik: hrvatski
• URN:NBN: urn:nbn:hr:159:758161
• Studijski program: Naziv: Molekularna biotehnologija; Vrsta studija: sveučilišni; Stupanj studija: diplomski; Akademski / stručni naziv: magistar/magistra inženjer/inženjerka molekularne biotehnologije (mag. ing. biotechn.)
• Vrsta resursa: Tekst
• Način izrade datoteke: Izvorno digitalna
• Prava pristupa: Otvoreni pristup
• Datum i vrijeme pohrane: 2022-06-29 11:51:30