Računalna analiza modela metabolizma glavnih nutrijenata

diplomski rad

• Naslov (engleski): Computer analysis of main nutrient metabolism models
• Autor: Sara Nadoveza
• Mentor: Ana Jurinjak Tušek (mentor)
• Član povjerenstva: Jasenka Gajdoš Kljusurić (predsjednik povjerenstva)
• Član povjerenstva: Maja Benković (član povjerenstva)
• Član povjerenstva: Ivana Rumora Samarin (član povjerenstva)
• Ustanova koja je dodijelila akademski / stručni stupanj: Sveučilište u Zagrebu; Prehrambeno-biotehnološki fakultet; (Zavod za procesno inženjerstvo); (Laboratorij za mjerenje, regulaciju i automatizaciju); Zagreb
• Datum i država obrane: 2023-05-31, Hrvatska
• Znanstveno / umjetničko područje, polje i grana: BIOTEHNIČKE ZNANOSTI; Nutricionizam

Sažetak

U ovom radu provedena je simulacija modela metabolizma glavnih nutrijenata pomoću softverskog alata CellDesigner. Napravljena su četiri jelovnika za četiri dana, namijenjena za dijabetičare, iz kojih su izračunate početne koncentracije ugljikohidrata, masti i proteina. Na temelju početnih koncentracija glavnih nutrijenata uspješno je provedena simulacija modela metabolizma. Rezultati ukazuju na sličan odgovor nutrijenata za sva četiri dana jer se radi o reguliranim jelovnicima čija je primarna uloga regulacija glukoze u krvi. Također je provedena analiza lokalne osjetljivosti parametara gdje je glavni cilj uočiti kako promjene u vrijednosti parametara utječu na izlazne varijable modela. Rezultati su pokazali kako promjena vrijednosti parametara k5, K5, k9 te K9 ima najveći utjecaj na acetil-CoA.

Sažetak (engleski)

In this work, a simulation of the metabolism model of the main nutrients was carried out using the CellDesigner software tool. Four menus for four days were created, intended for diabetics, from which the initial concentrations of carbohydrates, fats and proteins were calculated. Based on the initial concentrations of the main nutrients, the simulation of the metabolism model was successfully carried out. The results indicate a similar response of nutrients for all four days, as these are regulated menus whose primary role is blood glucose regulation. An analysis of the local sensitivity of the parameters was also performed, where the main goal is to observe how changes in the parameter values affect the output variables of the model. The results showed that the change in the value of parameters k5, K5, k9 and K9 has the greatest impact on acetyl-CoA.

• Ključne riječi: metabolizam glavnih nutrijenata; sistemska biologija; računalno modeliranje; CellDesigner; analiza lokalne parametarske osjetljivosti
• Ključne riječi (engleski): metabolism of main nutrients; system biology; computer modeling; CellDesigner; local parametric sensitivity analysis
• Jezik: hrvatski
• URN:NBN: urn:nbn:hr:159:259755
• Studijski program: Naziv: Nutricionizam; Vrsta studija: sveučilišni; Stupanj studija: diplomski; Akademski / stručni naziv: magistar/magistra nutricionizma (mag. nutr.)
• Vrsta resursa: Tekst
• Način izrade datoteke: Izvorno digitalna
• Prava pristupa: Otvoreni pristup
• Datum i vrijeme pohrane: 2024-05-15 10:55:20