Karakterizacija i kultivacija knock-out sojeva bakterije Escherichia coli

diplomski rad

• Naslov (engleski): Characterization and cultivation of secreting knock-out strains of Escherichia coli
• Autor: Katarina Brkan
• Mentor: Božidar Šantek (mentor)
• Ustanova koja je dodijelila akademski / stručni stupanj: Sveučilište u Zagrebu; Prehrambeno-biotehnološki fakultet; (Zavod za biokemijsko inženjerstvo); (Laboratorij za biokemijsko inženjerstvo, industrijsku mikrobiologiju i tehnologiju piva i slada); Zagreb
• Datum i država obrane: 2017-12-08, Hrvatska
• Znanstveno / umjetničko područje, polje i grana: BIOTEHNIČKE ZNANOSTI; Biotehnologija

Sažetak

Escherichia coli is one of the most commonly used microorganisms for production of recombinant proteins due to its numerous advantages. Many of the recombinant proteins E. coli produces are intracellular. To avoid cell disruption, ease protein yielding and purification, there have been attempts in improving extracellular protein production. One of the approaches, applied and investigated in this thesis, is using so-called leaky mutants. Due to mutations in genes encoding for proteins of the cell membrane, these mutants show an increased protein release from periplasm to nutrient medium after protein has been translocated by using natural bacterial translocation systems. Four E. coli knock-out strains have been cultivated first in flasks and then in bioreactors. Strains have been characterized regarding to their growth, protein production and secretion ability, using phytase as reporter protein.

Sažetak (hrvatski)

Escherichia coli je jedan od najčešće korištenih mikroorganizama za proizvodnju rekombinantnih proteina od kojih su mnogi intracelularni. Kako bi se izbjeglo mehaničko razbijanje stanica, olakšala izolacija i pročišćavanje proteina pokušava se unaprijediti proces ekstracelularne proizvodnje proteina. Jedan od pristupa, primijenjen i istražen u ovom radu je korišenje takozvanih leaky mutanata. Zbog mutacija u genima koji kodiraju za proteine stanične stijenke, ovi mutanti bi trebali pokazivati povećanu sposobnost izlučivanja proteina iz periplazme u hranjivu podlogu nakon translokacije proteina prirodno prisutnim bakterijskim translokacijskim mehanizmima. Četiri knock-out soja bakterije E. coli su kultivirani najprije u tikvicama a zatim i u bioreaktorima. Kultivirani sojevi su karakterizirani obzirom na rast, koncentraciju proizvedenog proteina i sposobnost sekrecije koristeći fitazu kao reporter protein.

• Ključne riječi: E. coli; cell wall; secretion; leaky mutants; phytase
• Ključne riječi (engleski): E. coli; stanična stijenka; sekrecija proteina; leaky mutanti; fitaza
• Jezik: engleski
• URN:NBN: urn:nbn:hr:159:750958
• Studijski program: Naziv: Bioprocesno inženjerstvo; Vrsta studija: sveučilišni; Stupanj studija: diplomski; Akademski / stručni naziv: magistar/magistra inženjer/inženjerka bioprocesnog inženjerstva (mag. ing. bioproc.)
• Vrsta resursa: Tekst
• Način izrade datoteke: Izvorno digitalna
• Prava pristupa: Otvoreni pristup
• Datum i vrijeme pohrane: 2019-11-21 14:16:11